Havørred Fyn er et samarbejde mellem alle 10 fynske kommuner og ejes i fællesskab af dem. Projektets samarbejdsaftale har til formål at genskabe naturlige bestande af ørreder i de fynske vandløb. Kommunerne bidrager til en fælles fond, hvorfra midlerne fordeles til vandløbsprojekter på tværs af kommunegrænser. Fordelingen og udvælgelsen af projekter sker to gange årligt af Havørred Fyns vandløbsgruppe, som består af repræsentanter fra de deltagende kommuner.
I år er der af Havørred Fyn fordelt samlet 1.560.000 kr. til projekter i de fynske vandløb.